临床上，脊柱裂可以分为隐性脊柱裂与显性脊柱裂两种。
隐性脊柱裂：是隐性椎管闭合不全中最为多见的一种，多见于腰骶部，有一个或数个椎骨的椎板未全闭合，而椎管内容物并无膨出。隐性脊柱裂患者多数无症状；有症状时，有的患者仅表现为皮肤长丛毛，或者色素沉着；症状较严重的患者则表现为腰痛、遗尿、下肢无力或下肢神经痛。多数隐性脊柱裂患者就诊时没有表现出明显的症状。
显性脊柱裂：在临床上也被称为囊性脊柱裂，此病患者在出生后就能明显看到腰骶部囊性肿物。随着患者年龄增大，囊性肿物随之增大。显性脊柱裂患者神经受到影响，表现为下肢运动、感觉的障碍等，临床上，也有伴有脑积水、唇裂等畸形的患者。
